/tools/

• ../
• ascat-app.nix
• ascat-callCNV.nix
• ascat-gccorrect.nix
• ascat.nix
• bowtie-align.nix
• bowtie-index.nix
• bowtie.nix
• bwa-index.nix
• bwa-index2.nix
• bwa-mem.nix
• bwa-mem2-app.nix
• bwa-mem2.nix
• bwa.nix
• cnvkit-batch.nix
• cnvkit-scatter.nix
• cnvkit.nix
• compression-bunzip2.nix
• compression-bzip2.nix
• compression-gunzip.nix
• compression-gzip.nix
• compression.nix
• crumble-app.nix
• crumble.nix
• delly-call.nix
• delly.nix
• facets-app.nix
• facets-call.nix
• facets.nix
• fastp-check.nix
• fastp.nix
• fastqc-app.nix
• fastqc-check.nix
• fastqc.nix
• genmap-calcmap.nix
• genmap-index.nix
• genmap.nix
• gridss-assemble.nix
• gridss-callVariants.nix
• gridss-collectMetrics.nix
• gridss-computeSamTags.nix
• gridss-configFile.nix
• gridss-extractSVReads.nix
• gridss-softClipsToSplitReads.nix
• gridss-somatic-filter.nix
• gridss-variants.nix
• gridss.nix
• hatchet-app.nix
• hatchet-call.nix
• hatchet.nix
• hisat2-align.nix
• hisat2-extractExons.nix
• hisat2-extractSpliceSites.nix
• hisat2-index.nix
• hisat2.nix
• infercnv-app.nix
• infercnv-infer.nix
• infercnv-ngchmr.patch
• infercnv.nix
• kallisto-index.nix
• kallisto-quant-empty.h5
• kallisto-quant.nix
• kallisto.nix
• last-align.nix
• last-index.nix
• last.nix
• lumpy-call.nix
• lumpy.nix
• manta-call.nix
• manta.nix
• minimap2-align.nix
• minimap2.nix
• mosdepth-depth.nix
• mosdepth-plot.nix
• mosdepth.nix
• mutect-app.nix
• mutect-call.nix
• mutect.nix
• octopus-call.nix
• octopus-callSomatic.nix
• octopus.nix
• picard-markDuplicates.nix
• picard.nix
• pizzly-app.nix
• pizzly-call.nix
• pizzly.nix
• platypus-callVariants.nix
• platypus.nix
• quip-app.nix
• quip-quip.nix
• quip-unquip.nix
• quip.nix
• sambamba-generic.nix
• sambamba-sort.nix
• sambamba.nix
• samtools-dict.nix
• samtools-faidx.nix
• samtools-fixmate.nix
• samtools-flagstat.nix
• samtools-index.nix
• samtools-markdup.nix
• samtools-merge.nix
• samtools-sort.nix
• samtools-tabix.nix
• samtools-view.nix
• samtools.nix
• snap-align.nix
• snap-app.nix
• snap-index.nix
• snap.nix
• snpeff-annotate.nix
• snpeff-dbnsfp.nix
• snpeff.nix
• snver-app.nix
• snver-call.nix
• snver.nix
• star-align.nix
• star-index.nix
• star.nix
• strelka-call.nix
• strelka-callSomatic.nix
• strelka.nix
• subread-align.nix
• subread-index.nix
• subread.nix
• whisper-align.nix
• whisper-index.nix
• whisper.nix
• xenomapper-allocate.nix
• xenomapper.nix