examples: added example tumour-normal calling pipeline script

1 files changed, 4000 insertions, 0 deletions

diff --git a/examples/sample1-1.fq b/examples/sample1-1.fq
new file mode 100644
index 0000000..743a5a8
--- /dev/null
+++ b/examples/sample1-1.fq
@@ -0,0 +1,4000 @@
+@SL1344_75135_75582_2:0:0_2:0:0_0/1
+GTTCAACGGGAAAACATTACTGCCTGAACTGACGTTAGTCATATACAGCCGCAGCGCCTTACCGTATGCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3370806_3371295_1:0:0_1:0:0_1/1
+GCGCCTGATTTTCCGGCGCCATGCCAGCCTGTGCAGGCGCATGCTGGCACTGACCTTCGCCAAACTCAGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2587576_2588033_2:0:0_3:0:0_2/1
+TGGAACCTATCGTTCCATGAAGGCTGCTTTACCGAATGAAGATGCGGCGGGGGTATATGAAGCGTTGCCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3906657_3907132_2:0:0_0:0:0_3/1
+TTGTGTATGGATAATGACAACAAATAGTTAACCAGATGTTATTTATTGGCAACGGTATTGTAGAGTTAAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2015028_2015601_4:0:0_2:0:0_4/1
+TATGCCGGCGGCGTGCCTGGCGCGCTGTCGAACCAACCAGCGCGGCCTAACTAGGCTCCGATCGCCACGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4589757_4590258_2:0:0_0:0:0_5/1
+GCTTGCTGATGTGAAACGTTGGTTTTTAAGATCATTTGAACTTCATACTCCTGCTCCAGTTTGCCTACCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4512065_4512640_2:0:0_1:0:0_6/1
+AGGGCGGCAATAGCCATGAAGTGACACTAACCCAGGTTTGAGGACAGTGGCGCTTTACGCCAGATGCTGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3881919_3882389_0:0:0_4:0:0_7/1
+TCAACGTCGTGTGGTCAGCGAAATTCTATGAGGTACAGAAATACCTCTCCCTCACTCATCACGCCTATTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3652145_3652649_0:0:0_1:0:0_8/1
+TTAATATCGCCATCCCGCGTAACCTGCGACATATCGCCGCTCACCAGCGCGCCGGTGCCGTTAAGGCTGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1006042_1006588_2:0:0_1:0:0_9/1
+GACCATCATATAGGCAGCCATCAGGCGCCCGCGATTATGCGAGGTTCCGCTGCACATCAACGCGCTCTCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_650718_651108_2:0:0_1:0:0_a/1
+ATTAACCTTATCGTCTTGTTAATTCAGGAGTCCCGCAAAAAATGACCGAATCCGTAGCCCGTTTGCGCGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1862564_1863065_0:0:0_1:0:0_b/1
+GATAAAGGCCGCAAAGAGGTGCTGAAACATGTGCATCGGTTATGGGGCTTTGATGTGATGCTGGAGCAAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2945461_2945940_0:0:0_4:0:0_c/1
+GCGTTTCCTGCTATCCCCATTCGACGCTGAACCTACCAATATGATGATTTTTTTATGGCAGAACAGCGAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_323559_324144_2:0:0_1:0:0_d/1
+AGGGTCAGGCGGACCCACAGCGGCGCAAACGGCTGGACATCGCCCAGGGCCAGCAGCGGTGTGACGAAGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3954184_3954651_0:0:0_0:0:0_e/1
+ATTGCCAAACACTTCCGCGTGCTCCAGAAACGCCTCCCTGCCAATCATGGTTTTAAACTCATCATGATTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_706183_706645_3:0:0_0:0:0_f/1
+ACTGCGCAAACGCTGAAAGCATGGCGCGAAGAACAGGGCCCCGAAGCGCCGCTGGCGTTTATTATCGGCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4301298_4301878_0:1:0_0:0:0_10/1
+TTTTTATACCCTAAGCGGTGAAGTGTGCCTGTATCTGGAAGGAACACCTCATATCCTGCAAACTGGAGAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3504676_3505204_1:0:0_0:0:0_11/1
+CGACGACCATATAAAAGGTGGTGGTTTTACCCGCGCCGTTTGGACCGAGCAGCCCGACAATCTCCCCGGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_156113_156607_2:0:0_1:0:0_12/1
+TGGCATTTGCGGAGCAGGGTATCACCGAGCTGTCCAAGCATGTGGCCTCGTTGATCACCATCCCGAAGGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4068840_4069271_0:0:0_2:0:0_13/1
+ATCATGTACCCGCTGACCAAAGCGCAGTACACGTCAATGGCGAAGATGCGTATGCTGCAGCCGAAAATTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2341616_2342169_3:0:0_4:0:0_14/1
+TTGGTGCTGTCACCCACGTATCACCAACCAGATACTGAATGGGAGGTTGTCACCCGAATAGTCATCTCGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4739970_4740465_2:0:0_0:0:0_15/1
+GCAACCTGGAAATAATGGAAAAGACATATAACCCCCAAGATATCGAACAGCCGCTTTACGAGCACTGGGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3804841_3805299_0:0:0_1:0:0_16/1
+GCCGCGCAAACGCGCGCTGTATGGCTCCTTCCCGCAGTTGGGCGCGCCGATCGGCTTCTTTTTTGCCAAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2995120_2995706_1:0:0_3:0:0_17/1
+TCCCGCGTTAATGGCTTCAACCGCTTTACCATCGACAAACAGCGCAGTCACTTTGCCGTTCAGTTCCAGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4845291_4845795_0:0:0_0:0:0_18/1
+GCGCAGCGGGTCGCCCGGCATCAATACGACGTCAGCGAAATCACCCATTTCTGCATTAATATGTGGAGTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4696928_4697431_1:0:0_0:0:0_19/1
+AAAAGAAAAGCATCCGTAGTTCTGCGAAAAACGGATCGTTTTATTTTGCCGTTCTGAAAAGCAAACAATG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4634442_4634998_0:0:0_2:0:0_1a/1
+ATTACACGATCGCCCTTTTTTGTTGATCCTCGATGGCGTCACCGATCCGCATAATCTTGGCGCCTGTCTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2445334_2445856_1:0:0_3:0:0_1b/1
+TCAGCGCTTCACTGTGAGCGGCGCCTGCACCAAAAGCCGCTTCTTGTTTAGTGCCGACCATTTTCCATTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3165784_3166350_1:0:0_1:0:0_1c/1
+CGCCGCTCCGTACGCGTCACAATCGCGCGTGCCAGGATCCGTTCATCGGCATACAGCGATAACCGCCGCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2979962_2980457_2:0:0_1:0:0_1d/1
+CCCCTTTTTCAGGGGATTCGTGTGCCGGTGGATTAGATCCTCAACGGGTTTCAGCAACTGCTGCTGGGAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_997135_997614_4:0:0_1:0:0_1e/1
+CGACATGAAAGAGGCGGCTAACGCGTTACGGTGGAGCGTGAATGAGAAGGAGCGTCGCTATAAGCTGATG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3594438_3594889_1:0:0_0:0:0_1f/1
+TGTACAACAGGGCGCAAAACGCTACGCAGATGGGCTGGGAATGCTGGTGGGGCAGGCTGCACATGCCGTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3456734_3457213_3:0:0_3:0:0_20/1
+GATGAAGTTTATGCAAAACAAGTCCGGGCGCAGGGACATGCAGGCGATGTTTTATTTGCGATCTCTACGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3892658_3893212_0:0:0_0:0:0_21/1
+GCAGGGCCATGCGGCGTAAACGCTCGCGTCCCGGCCCCGGTTCATCGCGGTGCTGTTCGTGGTAGGTCGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4443977_4444389_0:1:0_0:0:0_22/1
+GAGGCATCAACGATATCCACCAGATAGACCAGCAACGCGGTCAGGTCGATTTGCGCGAAACGTTCGGCGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1484094_1484605_2:0:0_0:0:0_23/1
+CAGCCAGGTGGCGACCGCAATCAGAACGACAATACCCACGATGGTCAGCAGCAGATTCCGGAAGTTGCTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1480180_1480714_1:0:0_0:0:0_24/1
+TATTGGCCGCGATGGCGGAGTTTTCGCCGCAATCAAAGTCCAGGAATGGGGCAACCTGTTTACGAATTTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1963763_1964217_1:0:0_2:0:0_25/1
+ATGATCCCCATTCGCCTGCGCGATCATGTGTTTTATACCGCTTTTGCACCGTATAACAACCCTAAGGTCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3736366_3736901_0:0:0_0:0:0_26/1
+CGCTGAGAAAGAAAATTCCGTCAACCGCATTTTTTTTGCAAAAAGAAGTAGACAACTGCGAATGAGAATG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1323640_1323966_1:0:0_0:0:0_27/1
+GAAGATAGTTGCCGCCTGTGAAGAAAGCCTGCGTCGTCTGAAAACAGCTTATCTCGATCTCTATCTATTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3001529_3002031_1:0:0_0:0:0_28/1
+CATAATGATGCCGATCAGCGCCGAAACGAACGCCATAAACGGCAGGATTGTTTTCAGGACCGTATCAATG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3716122_3716571_1:2:0_1:0:0_29/1
+AGTGACGCACCCGGCGTCGAGGTGTTAGGGGTGTTGCTGCTACCTGCAGGACGAGCGGTAACAGAAGTTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2043413_2043957_0:0:0_2:0:0_2a/1
+GTTGTTTTTGCTTATCCGGAAGGAAAAGATAATGCACAGAATTGATCCGCCCACCGCGCAAAAAGATAAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2035094_2035593_1:0:0_4:0:0_2b/1
+TGGCTACATATTCATATAAATTATTATCATAAGGGAATACATAATGAACAGAACAGTTCTGGCACTGCTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3706303_3706714_2:0:0_1:0:0_2c/1
+CCGGTCCTGGGCGAAGCGGGTGGCGATATCATTGTAGCGGCTGAGGTCGAGGTCAATAATCGTCACGTCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2581493_2582004_1:0:0_3:0:0_2d/1
+ACTCTAAAACGCCAGGTCACCCGGAGATTGGCTATACGCCCGGCGTTGAAACCACCACCGGACCGCTTGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3632814_3633304_1:0:0_0:0:0_2e/1
+GGAGCGTACACATAGTACGTGAGGATTTCGAGCACTGCCCGGCCCTAAAATGGCGAATAAAATAGCCTAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_297272_297813_1:0:0_0:0:0_2f/1
+GCAAAGACCCCCATCACTAGGATGGTAGCCAGCGCAGCATACTGCGTGGAGGCCGTCACCTGGAAGACCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4540154_4540591_2:0:0_3:0:0_30/1
+TAACTAAGGGTAGGTGAGCCAATGACATCCGCTTCTGCATTTCATTTTGCATCACTGGTGTGGGACTGGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3136615_3137075_1:0:0_1:0:0_31/1
+ATGAATAACATCTCCCCCACCCGCTGCGCGCTTTGCTCTTGCAACAGGGCATCAAACTTTTTGCCGCCAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4327997_4328477_3:1:0_3:0:0_32/1
+CCATGACTGACGATATAGATTTCCGTCGGGGAGGTCTGTCCGCCTGCCGTAGGTTTTACGGGTTGTGGAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2127529_2127956_0:0:0_0:0:0_33/1
+TGCCGGTGAAGCGGCTGATCGCCAAACTGGGACTAAGCCCCTGGTACCAGGAAGCGCCGCTGGTTGAAGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_668746_669215_1:0:0_1:0:0_34/1
+ACGTGAAATGTGGCAGAAAATGGAAAAAGCGTCATGGATACTCGACTGTAAAAAAGACGCGCCGGTGGTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2497778_2498270_2:0:0_0:0:0_35/1
+CTGACGCTTTTTGACATGCATGAAGCGTTTGCCGCTCAGACTCTGGCGAACTTACAACTGCTGGGCAGCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4760985_4761454_1:0:0_3:0:0_36/1
+CTGATTACGCAATACGTTAATCAGGAGAAAGATGACGACAGCGACCTGGAAAACACGCTGGCGATGCAGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1243377_1243935_3:0:0_1:0:0_37/1
+ACGGATGTACTCATCCATTTCCGTTTTCAGGTTATCGGATTTCGTACCGAAAATAGCCTGAACTCCGGAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3278844_3279329_1:0:0_2:0:0_38/1
+AATGCCAATACGTTTTGCCGCTTCGCGCCAGCGCTCGGCAATGGGCGTTTTTAACAAAATATTGAGATCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1373627_1374059_1:0:0_1:0:0_39/1
+ACGGCGTTGAGCCGGTCGCGGGAAGCTTCAATGTCGTTGTGGTTGGGGAAGTGGTTGAGTGCGCCCAGCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3110363_3110956_1:0:0_1:0:0_3a/1
+GTAAACGGAGCGATTATCCCAGTCGATAATCGGTAGCACTTTAAACACGCCGCGCTGGATAGCGAGAACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4186063_4186583_1:0:0_1:0:0_3b/1
+AAAGCCAACAATCCATTTCGCCAGACGCTGATAGCCACGGCGCATTTTCGGCAGCGCGAACAGGCTGGCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1299634_1300082_2:0:0_0:1:0_3c/1
+GCTGTAACTGCTCGCAGCGGATATTGTCCGTGATATAACCCTGATGCAGCGCCACAATGCGATCAGCATA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3974003_3974384_1:1:0_2:0:0_3d/1
+TAAAGAGAGGAGCCCATGAGCTGTAAACGTTATCCCGAAGAGTTTATAATTAAAGCGGTAAAACAGGTTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_921754_922253_0:0:0_4:0:0_3e/1
+CGGCAATCGCCAGCAAAATGCCGGGGAAGGCGAACAGCAGCTCGCAACTGCGCATAATAAAACTATCCCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1663006_1663468_0:0:0_5:0:0_3f/1
+AAATGTAATGGAACATCTGTTTGATACGGTCGGGGCTCAGTTGGCTCATCATCATATGACTCCTTTATAG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4070465_4070877_0:0:0_1:0:0_40/1
+TGCCGACATCTGGCCGGACTTTATCGCCCGTCTGCCCAAAAATCTACCGATTACCGTGGTACGTAACAAG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2708987_2709514_2:0:0_1:0:0_41/1
+GGCTTCGACGTTGACGGCGGAACAGTGGCGACAAGTGGCCGCAGAGCTGCACGACCGTATGAAGGAGACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1494636_1495154_1:0:0_0:0:0_42/1
+CTGCTGTGCAAGAAAATCCATTAACGCGCGATCTTCGACAGCTTTTACGCCATGTCCGAAACGTTCGGCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2241404_2241923_1:0:0_4:0:0_43/1
+TTAAAAATATGGCTATAAGTTGCGGACTGATTAGGGTTAATCGTAAAATCCTCACGAATAATTAAATTAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4361144_4361702_1:0:0_3:0:0_44/1
+ATGTACTTGACTTTAGCGCAGATGTTGATGTGGTGTTCCTGGCGACAGCGCATGAAGTGAGCCACGATCT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4658270_4658785_6:0:0_0:0:0_45/1
+CAGAAAGCCTTCGCTCCGTACTGTAAATGTTAAAATTTAGTTAATTTATGTGGCATCCTCATAGACCTTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4488665_4489174_2:0:0_3:0:0_46/1
+GGAGATGCCCGGCGAACAGATCATGATGCGTATGCAGGCCTCGCTGTCCCTCGTCGATCAGACACGTATT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3195449_3195964_1:0:0_0:0:0_47/1
+CGCTGGGCGGAGAGCCACTCTTCCAGCAACGGCGACTCCTGCGGCACAATATTCAGGCTGACATCCGGAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1305555_1306111_1:0:0_0:0:0_48/1
+CGCTGAACGACCCCATTGAGCTATTGCTGGAAACGATTAAATATTGTAGTGAAGGTATGCGAGTTGAAGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2765361_2765856_1:0:0_1:0:0_49/1
+TTTGTTGAACCAGAACATGCGAGAGCCGCAGCACACGTGTAAAATGGTTTCTGCCATCTCATTCCACCTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3776352_3776887_0:0:0_3:0:0_4a/1
+TGCGGACGGGGTGGGTAAGTCGCGCCTGCTGTCGCTGATTTCTGGCGCGCGGGTTATTGAGCAAGGGAAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1564965_1565432_0:0:0_4:0:0_4b/1
+GCGAGCAATGACGCCGTCAGGTTGGGCGTGACGTGTGGTAGGCGAGATAATACGGTAATCAAGAATATTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3757830_3758325_0:0:0_0:0:0_4c/1
+CTGCAATGGGCTTCCGTTCGCAGGGAAAGAGTCCCTGTTGTCTCTTCCCCGCGCGTCATCTTTATGTCAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_198716_199198_1:0:0_0:0:0_4d/1
+CTTTCGGCGGCTCCATTGGATTACCCGGGGCGCGTGGGATCAGCTTCGAGACAAACGGCAGCGCCATCGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4022099_4022580_1:0:0_1:0:0_4e/1
+TATGTACTGGCGGAGTGGCACATCTTCCGGTGGGGACCCCTGAAAAGCGGCGGTAAATATCCGTGGACGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2237783_2238384_0:0:0_1:0:0_4f/1
+CAGGTATCGCTGATTACGCCTAATTTGCCGGAAGCCGCAGCGTTGCTGGATGCGCCCCCTGCGCGTACGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4078054_4078588_1:0:0_0:0:0_50/1
+TCGGCGTCATACAGCGGAATATCCCCGATCGAAGGCAGCGGCGATACCGTCATTCCTGCCGGCGCGACTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1918814_1919313_0:0:0_2:0:0_51/1
+TGCTAACCCGGTCACATATAAGCTACTGTCGAAACAGGATATTGCCTTTCTGAAAACAGGCCTCCTGACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4759825_4760307_0:0:0_2:0:0_52/1
+GAACGCCTAACCGCGATACCATTCTGAAGAAATATAAAGGGATGGCAGTAAAATCGGACGATCTTCTGAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_440329_440860_1:0:0_0:0:0_53/1
+CTATGATGCAACCTCTTTATCTTGTTGGCCCGCGGGGCTGTGGGAAAACCACCATCTGTATGGCGCTGGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4755283_4755764_3:0:0_0:0:0_54/1
+CGCTCACGGTGGGCACAGTCCATTCTCTTCAGGGCGCTGAAAGAGCGAATGTTATAATCTCGCCAGTGTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4521927_4522384_3:0:0_1:0:0_55/1
+GATTATTAACCGACTGTCTATAGACATACCTGCGGTGCCACGTGTCGCGGTGGTAGGCGACTGCGGAGCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1269900_1270432_1:0:0_0:0:0_56/1
+GTTTACGCGCTTCAAACTGCTTACGGTCGAAATCGCGAATGATGTAGTGCATTTCGGCCCGGTCAACGGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4785705_4786110_2:0:0_3:0:0_57/1
+TTTATCTTTTCTTATGACGATGAAAACCTGCACCAAGCGCCGTTTGATAATATCCGCCTGTTTGAGTCTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2140784_2141291_0:0:0_1:0:0_58/1
+GAGGATGTGCTGGTAGTGTGCCGGGCTGAGTTTGCCTTCCGGAAGCAAGGGGTCAAAAATGGTGGCCAGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4684999_4685591_0:0:0_0:0:0_59/1
+ATCACACCGTTTAACTTCCCGGCAATGGTGCCTATGTGGATGTTCCCGGTTGCTCTGGCTTGCGGCAATA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1007146_1007575_2:0:0_1:0:0_5a/1
+GGCGCTGTTGTTAAGTTATACGGTAGGTAGCCTGTTGGGGCCGTCTTTTGCTGCGATGTTAATTCAGAAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1339581_1340118_0:0:0_1:0:0_5b/1
+CTTCCTTGGCGATGAGTTTGGCTTTTCCGGCAAACTCCGTCTGTAGCACACAGCCAAGCAGTAGCCCCAG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2906199_2906712_1:0:0_1:0:0_5c/1
+CGATGGTACTCGGCCCGAATGAACTGGCCGATCTGAGCAATCAGACCATTATCAGGCCCGACACGCTCTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_309004_309451_1:0:0_2:1:0_5d/1
+GTACTTGAGCTGGTCACGGGCGGCGTTTATATCTGGCTGCCGTTTTCGCAAATACGCTCGCTGGAATCGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3133108_3133639_2:0:0_1:0:0_5e/1
+GGCGGCGCCAGGCAAACCCACCGCTATTGATAGGCACTGGATCTGGCAGGAGGGCGATTGCCGCCTGACT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2757849_2758428_3:0:0_1:0:0_5f/1
+GATAGTACCTCACGGCATTCATCATAGGTATCATCATCAATTTCGATATCAGGGTCCATTCCTCCTGTTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_977549_977994_2:0:0_0:0:0_60/1
+GCACCGCTTCAATAAGAAACTGCTGTAGCACATCGCTGGCGCGCGCGCCTACCGCCATACGGATGCCGAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3321523_3322037_3:0:0_3:0:0_61/1
+AAACTGCTGCCCTTCAAAACGGTAGTACCATTTCGCCATCCGACACTGATCGTGCATCGTTATTTTACTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2049639_2050193_2:0:0_1:0:0_62/1
+CCGCAGGTAATTCGGCAACCAAAGCCCAGAAACAGGCTATGGCTTTCCTGAAGCAGAATCCCCGGAAACT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4628579_4629134_1:0:0_0:0:0_63/1
+TTCGCGGCTTCAGCATCACCTTCACCACGCATGATACGCCCCTGACGCTCGGCTTCCGCCAGAGTTTTCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_710555_710965_1:0:0_2:0:0_64/1
+ATCTCTTTACGCTCAAGTTTGGTGTCGCAGCGCCAGCAGCAGCCGTCGATCACCTGTTCGTTGGCGAGAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4579413_4579883_3:0:0_1:0:0_65/1
+TCGCCATAACCGAATAACGAATCTCTCGGACATCGGCTTAATTTTTAAGAAATGCGTTACGACATCAGTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3483635_3484093_2:0:0_1:0:0_66/1
+GAAACTGCCTGACGATGTGGAAGAAGCCATCGACGCCGAAATGGAAAAAGAGATCACCTGCGTAGACTCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4395787_4396313_1:0:0_0:0:0_67/1
+TTATATTTATTTATTGTCTTATTATTATTGTCGCCACCGCTATTCTTCATCTAGTCAAAACCAGCGCGGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1903409_1903900_4:0:0_4:0:0_68/1
+TAAGGCGGTATTTAGGCTGTGTATCCAGGGCGACGACATGATCTCTGGGCTTGGCTTTACCTGGCAACAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1952823_1953339_2:1:0_2:0:0_69/1
+TCCTGACCGCCGACATCGTCGAGGCTATCCTTGAACGTAGCGGCGCGCAGGACGGCGACATTATCTTCTT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3544573_3545090_2:0:0_2:0:0_6a/1
+AGTGCCGCCGTTTCAACAGAGGTCGCTACGCCCACGCCAACCAGCCGCTGCGGACAAGCGTTGAGGCCGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_247941_248426_1:0:0_0:0:0_6b/1
+GAGTCTATGTCCGGAACGTATAATGCTACTATTCTCCGGGTGGTGGTTTCCGCCTGGATAGGAAACTGCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2879281_2879733_1:0:0_1:0:0_6c/1
+TCTGTTTGTACATTACAGGAGTATAAAAACATTCGAGAATTTCCCTCATCTAATGAATTTAAGTCTTATT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4749175_4749724_3:0:0_0:0:0_6d/1
+CGGTATCGACAGCTATAAATCGGGTAAAACCGGCATCGACATTCGGAAAATACATGGCGCTGCCAAAGAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_632497_633057_1:0:0_0:0:0_6e/1
+GATATAACCGACAGCCAGTTTTGACGCTACACAGTCCAGAAAGTATTTTCCTGGCCAGAAGCCGGTTAAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2356689_2357195_0:0:0_1:0:0_6f/1
+GGGGATATCCGAGCGTAGATTTCAAACGGGGCGAGTGCAGCTTTAGTTATGCCTGTGCGCAGGCCTGTAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3743059_3743525_0:0:0_1:0:0_70/1
+CAGCGAGAACCCCGCCACGGTACCCGGCGTACCGGATGCCAGATGCGACGTCAGCGACTTTTTCGCATCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2940388_2940854_0:0:0_0:0:0_71/1
+TCTGCCGCGACTGACCATCGAGCCAACGCGTTTCGCGCAACTCCGCCACGCAGGACTTCACCACTGAGAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3199851_3200287_0:0:0_1:0:0_72/1
+CCGCTTATCCGACGAAAAAAGTGTCGCGTGCCGACGTTGCGCCCGTCACCTTAGGCGATAACCTCACCAG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2799294_2799851_0:0:0_2:0:0_73/1
+TTCACCCCCAGCCACAGGTCATCCGCTAATTTTTCAACATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1689023_1689464_2:0:0_0:0:0_74/1
+CGACACTCCAGATATGCAGCCCGCTCTGCTCGATGCCGTCATCCGCCACCTCCGAGAGCGTCTCCTGCAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4410774_4411206_0:0:0_0:0:0_75/1
+CAGAGAGATTCAGTTGAGATTCACGGCGAATGAGACGCTTAAGCGTATTCAGGCTGACCCGGACAGGCTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2811216_2811638_1:0:0_1:0:0_76/1
+TTCCGGTTGACGCCCGTCACACCAGACCACCACCTGCTTCGCCATGCTCCCGCTGTCCGGACCAAACATC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1904111_1904641_0:0:0_0:0:0_77/1
+TTGACGCCGATCTAAGCCTGAGCGGCGCGAAGGTGAAACTGGAGAGCCTCGCGGCCCTGGTCAATGGCGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2407136_2407709_2:0:0_3:0:0_78/1
+AGGTAGCGCGGCGACTCCTTCTTTTACGTTATGCAGGACGAAGCGCGCCATGAGTATCGCTATCGGTTCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4746554_4747083_4:0:0_3:0:0_79/1
+AGTACCATTAACGCCGGATCGGCGTGGGTAACGTTAAAAATCGGCAATACGCCGCGCGCTGTGGTTATCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1758425_1758790_1:0:0_1:0:0_7a/1
+GAAACGCTGGAGATGCTGCAAACCTGTTATGAACAGCTCGGTAAAAATGCCGAGTGGGCGGAGTTTTTAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4691209_4691739_2:0:0_0:0:0_7b/1
+CCTATCGCAAAGACTTCGCTGGCCGCCATCTGCCAGTAGCCAGGGTTAAACAGTTCCAGCGAACAGATCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4265199_4265778_4:0:0_1:0:0_7c/1
+GCCGCCAGCCCGAAGCAGAAAGCGACGCTCCAGTGGTTGATGCGTTCCGGCGCCGTATAGCGCAGTATGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3184234_3184723_2:0:0_1:0:0_7d/1
+CGTGTTGCGCAACGCAGAAGCGGGTTTTCCAATTCTGGTCACTGACAATAAACAGGATCTTACACTATGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1079586_1080151_2:1:0_0:0:0_7e/1
+CGGCCACCACCAAAGCAGCAGCACTGCGAACTGACACGCTGACCACCCGTTTTGCCACCCGGTTAATGGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4820407_4820884_1:0:0_0:0:0_7f/1
+CGTCCTTCGGGTTGTTGAAATGCAGCGTGATAGTGGACACATCGTGACCCAGCACCAGCGTCTGTTCTTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_695167_695754_1:0:0_0:0:0_80/1
+AGTTTTAGCAGCTACAATATTTTTACCATTGCCTCGCTGATCGCCAGCAGCGATCTGCTGGGACTGATGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4735788_4736241_1:0:0_1:0:0_81/1
+AAAATACATTTTTTGCAGTTCACAAAAGTCTGGTTCGCTACAGGATAACGGCGCCACGCCGCCGCCGCCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4642415_4642930_2:0:0_2:0:0_82/1
+CCAGGGCAACGGCAAAATAACTATAAACCAGGCTGGATGAGGTGCAGCCATGATAGAACACCACACAGGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4648833_4649336_1:0:0_3:0:0_83/1
+GGAGTCGCGAGCAGCGCCTGGCGCTGGTGAGCGCGGTTGCTGAAACCGGCGTGCGTGTGGCGTCCATGTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3041642_3042190_0:1:0_4:0:0_84/1
+GCATTTTATTCATATTTATACATCATACGTTCCCTCTGAGAACTATTTGCCTGAACGGTTTATACCGAAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_290105_290631_1:0:0_0:0:0_85/1
+GCGCCCTCCCGAAGGTTAAGCTACCTACTTCTTTTGCAACCCACTCCCATGGTGTGACGGGCGGTGTGTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2735240_2735673_1:0:0_1:0:0_86/1
+TTCCCAGTGGCGGGAATCCTCCGGCATTTTCCCTGACGCCGGATGGAAAGCTGACTGCGAAAAATGCGGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3924058_3924584_2:0:0_3:0:0_87/1
+ACAACGTCGCGAAAGAGAGCCTGAACGACGTTATGGCGGAGCTGGGAATGACCTAAGGTTTCGATGTGGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3432744_3433288_1:0:0_1:0:0_88/1
+TTGACTTTGGCGCGCCCTTCGGCATCACGACTTTGCCGACAATACCCAGCATTGCGCAAGAAAGAGAAAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4410089_4410588_1:0:0_0:0:0_89/1
+CTCGGCAAAGTATTTCGCCAGCCCTTTGATGGACGAGAGCGGGTTACGAATTTCGTGCGCGACGCCCGCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4835789_4836286_3:0:0_3:0:0_8a/1
+CCGTGGGCGTTTTGCAGTTTGACGTTGTTGTCGCGCGCCTGAAAAGCGAAAACAACGTTGAGGCGCTATA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4360531_4361086_1:0:0_2:0:0_8b/1
+GCAGTGCCCAGACCAAAGAGCTTATTGTCGTGCTCGGTCAGCGTGAACGGGTCGCGCGTCCAGCGTCCGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_591170_591604_0:0:0_2:0:0_8c/1
+TCTTTTCATCCGCGCTGAGTATCTCCCGTGCCGTTAGCGGGCTGATCCCGCCGACTTCGGCGCTCAAATC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2832697_2833158_2:0:0_0:0:0_8d/1
+ACTTCAACACGCCGTGGCTGGAAGTGCAGGATTTTTTAAGCTAAAAAAATGGCCGACATTACATGGGCCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1990024_1990466_0:0:0_2:0:0_8e/1
+TTTATAGCATTTTAATAACGGTGCCCGGTCAGAGCGCGATCTTGGGGATCTTGTCACTAAAGTTTTTGAG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1249717_1250282_0:0:0_2:0:0_8f/1
+CAGCGCCCAGCTCAACCAGTTACATGAACGCTGGCAGGAAGAAAAAGCAGGTCATTAACTCGAGTTTTCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1862191_1862707_0:0:0_0:0:0_90/1
+GCAGCATCTCGATTACAGCATGTTCATGCGCGGCGGACAACGCTCCAGCAGTTCTACGCTGCCATCCTCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4170222_4170649_1:0:0_1:0:1_91/1
+CACTGCGAAGGTAGCAAGGAAGAAGTGGTGCGCGACGTCAGTCGCTTCTATTCGTCATCGCACGATCGCT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_692516_692971_0:0:0_2:0:0_92/1
+CAATGGTTTTAAAACTCTGGCTGAAGGTCAGCGCGTAGAGTTCGAAATCACTAACGGTGCCAAAGGCCCT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4691644_4692117_2:0:0_4:0:0_93/1
+TGAGCTAGTGCAGAAGGGGTATGAGGGGAACTGTTCGCTGGAACTGTTTAACCCTGGCTACTGGCAGATG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_420216_420623_3:0:0_2:0:0_94/1
+TGCCGTTTTACCCGCGGCCTGCATCTGCTCATACAGCGACATCGCCGCTTCGACGGCTGTTTGCGAGTGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_914582_915056_2:0:0_0:0:0_95/1
+TATCGGTACAGTCCAGCACCCGCGAATGCCCGGCAATCAGGCTGGTCATAGCGTCGTCGTGCAGCCGCGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1571298_1571807_0:0:0_0:0:0_96/1
+TCGCTTTAGCATCCGCGCTGACGCGTTTTAACTTCTCCAGGAACGGCTCGCCAGCCAGTATGCAAAACAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3104405_3104959_1:0:0_1:0:0_97/1
+GGGGCTTTGGCGCTGATTTCGACAATATGAAAATCCGCTGCTGGTATGAGCATCACTTCCCGTTGCTGAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4414083_4414577_2:0:0_2:0:0_98/1
+ACACAATGGCGTTGGATTTCACGAACTTGGCGACCTTCCAGCATAACAGCGCATCGCGCAGGTCCTGCTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2114978_2115461_1:0:0_2:0:0_99/1
+CGGAATTTGTCGGGACCGCCATTGGCGATACCCTGGGCCTGGTAATCGCCAACGTCGATACCGCCCTGCT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4805589_4806124_3:0:0_4:0:0_9a/1
+CGCCTGGGATATGGCGGCCATCGCGGTGATTTGCAGCGCGTAGGGGGAACCGGCGCTGGCGTCCTTGACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2627333_2627748_0:0:0_1:0:0_9b/1
+GGGTAGCAGATGGGACGGTAAATCGCTGACCAAAGAAGGGGCAGGCACGCTGATCCTCTCTGGCGACAAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2671451_2671979_2:0:0_3:0:0_9c/1
+TGAGGGGAGTAAGAATGAATTACTCCCTCGTTATCAATAGCTTTTTGTAATGTTTCAATCACCGGCATAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2093835_2094302_0:0:0_0:0:0_9d/1
+CGATATTAAATATTTATTCGACCATGTTCCTGTAGGAACCCGCGTTCAGATTATCGACAGGCCCGTTAAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1417317_1417762_2:0:0_1:0:0_9e/1
+TTGTAAGGTGCTGAACAACGGCGATCTGGGCGAGAACAAAGGCGTTAACCTGCCGGGCGTTTCTAATGCT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3519739_3520179_1:0:0_2:1:0_9f/1
+CTTCTACCAGTTCGGGGTTCACGCGTTTACGGAAATCGCCATCTTCTTCCAGCACATAGGCGAAGCCGCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_800809_801255_0:0:0_3:0:0_a0/1
+GATCGGATAAGAAGTCTTCCTAGATCTGTTCTATCCAGCTCTGATTCGAACCAGAGAGGTAAGAAGAGTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_28971_29357_0:0:0_4:0:0_a1/1
+GTCGTGTACAGCATTCTTTATAGTGGAACGGTGACCGTACCGCAAAGCTGTGAAATCAACGCCGGACAAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3776314_3776807_4:0:0_2:0:0_a2/1
+CCGCAGTTGCTGCTCTCTGCGGGTTGCCATTATCTCGCCCGCATTCATCGCCACCAGCCAGTCAAAACGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2920555_2921157_3:0:0_3:0:0_a3/1
+CCCGCAGCAGGGGAATACCGCACATGCTGATATGCTCCGGAGCCCAGGTGAAAATGGTGATCTCATCCAG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1008927_1009445_0:0:0_0:0:0_a4/1
+TTAATTTTCCCACTGCTGGCGCGTAGAAACACATAACGACGCTCTTTTCCACGGCGCTCCTGTCAGGCGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4229080_4229504_0:0:0_1:0:0_a5/1
+GCGGCAGCTTATCGGTATAGGTGGATTTTAGCTTCGCCCGACCACGATACTCCAGAATCACTTTCGGCAG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2644932_2645440_1:0:0_1:0:0_a6/1
+CGATAAAGACCTTGTCATCCCTGTCACCAACGCCGAATCGAAAACGGCGTTCGAGGGAGCAGACGGCGGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_311830_312335_0:0:0_1:0:0_a7/1
+CGTGAGCATGAAATCCGCACCATGACGGATATTCTGCTGCGCCGTCGCCAGAATAATCCACTACTGACTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3311492_3311959_1:0:0_3:0:0_a8/1
+GAGCTCAATGAGTACTGCTGTAGCGGGATGCTAATTAGAACCGCGGTGCTGACGTTGTGCCGCAATTACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4532478_4532938_4:0:0_2:0:0_a9/1
+TGGCGGCGGGAGAACCCCTGTGCGGGCAGCCAGATCTGGTGGGGCTGTTCGTGGTCGTCACTGGCGTGAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3952283_3952788_2:0:0_1:0:0_aa/1
+TGTTTCAAAAAGAGCTATATGCCGGCATTTCGTTCGCCTCGGCGGTGCTCTCTATAGCGCTGCAACATTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3924245_3924653_2:0:0_0:0:0_ab/1
+TCAAAACCTTTCTGGAAATCATCAATAGAGAACCGATGGGTGATAATCGTTGACAGATCCAGACCGGACT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2162849_2163350_2:0:0_2:0:0_ac/1
+TGGTTCTTCTGTAGAAAGTGAAGCTAATCGCTTTATAGTATTTTGCAGCATTGATATTTTACCTTCAACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4374102_4374590_2:0:0_0:0:0_ad/1
+CCTCCTTACCTTAAAGAAACGGTCTTTGAAGTGCTCCCACAGATTGTCTGATGAAAAACGAGCAGTCAAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2155049_2155488_1:0:0_0:0:0_ae/1
+TTAGCGACCTCTTCATCCACCTGTTGGCTATATTCCGCCAGCCGACGCTGCGCCCCTTCAGCGGTAGTAC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3652030_3652408_0:0:0_1:0:0_af/1
+AACGCCACGATTAAGAATACCGGTACCTCTGACATCAGCGGCGCAGGCTCCACCGGCACCGTCATTGACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_847760_848264_4:0:0_1:0:0_b0/1
+CACGCGTGATTGCCCTCGATTTAGACGGAACATTATTAACCCCGCATACAACCTTACTCCCCTCCTCGCT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2674058_2674566_2:0:0_2:0:0_b1/1
+AGATGCGCCGGTTTATGCCTGCCTGGACGGTAAAGGTATCAGCTTTGACTCCGGCGGCTACAGTATCAAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4676555_4677031_0:0:0_1:0:0_b2/1
+CTCAGGCTACCGGTGAGCTCACTGCTTTGCTGTCGGCAATAAAATTGGGCGCCAAGATCATCCACCGGGA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_936220_936736_2:0:0_3:0:0_b3/1
+GTTCAATTGCTGCAGGCCATAAAACGCAGCGATAAACTTCAACTTAAAGAAGCCGCGACCCTGTTGGGCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2318887_2319304_0:0:0_2:0:0_b4/1
+GGCCAGAGGGTGCTTTTGCTGGAGCGATTTCAGGAGGGCAAGAATCTGCGCCTTAACGGTTTTATCCAGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3490500_3490993_0:0:0_0:0:0_b5/1
+GTTGTCTGACTTTTTCAGCATAATCTTAAGCAGATCGTGCAGTGGCGCCGACTGTTTACTGGCGACGATC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2431906_2432410_1:0:0_3:0:0_b6/1
+ATGAACGGCCCCAGATCCTGGTTGCGGTGGGTACGTTTGGTGAAACGGAAGCGACGGAAACTGTGCCCCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1954071_1954553_2:0:0_2:0:0_b7/1
+AGATATCGGTACTTGAGACGCGCCTCTTCGTTATTAACGTGGTTAGCGTCAAGCGGCAGTGAGTCTGCGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3777728_3778229_0:0:0_3:1:0_b8/1
+ACTGCGCGGCGCGCATTTCACTCTGGCGTTGCTCCAGCAAGGCACGGGCGGCGGCAACCGCGCTTTCGGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_336933_337397_3:0:0_3:0:0_b9/1
+CGGGTTTATCGACACGCTAATCATGACTAGCGAGATTTTTAATCGCATTCTCCAGTTCGATTCTAAGTTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_25983_26482_1:0:0_0:0:0_ba/1
+CATGTGGAGTAGTCGCGTAACCGCCAGGCCCCCAGATTAAGGCCGCTATTCAATCCAAGAAAATAGCTGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2441020_2441536_4:0:0_3:0:0_bb/1
+TGGCTGCGACGTCAATCCAGCGTTATTTCCAGCCGCGTTTTTGCCAGTCCAAACTCATTGTTTCCCGCTG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4572662_4573180_2:0:0_1:0:0_bc/1
+TATTTCCAATTTTTATTTCTCACATTGCTTCCATAATTATTAATAATATGTAATGAAAACTAATCATAAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2642868_2643287_1:0:0_0:0:0_bd/1
+GTGCTGGTGAAGTCGGTATTGCCGATCGCCATGCCGTTAAGGGCGTTGCGCGAATGGATGTTCATCTTAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_991491_991896_2:0:0_4:0:0_be/1
+ATGATCATATGTTGCAGGATACGCGCCATGATCCAGGGCTGAGCGACAATTAATACGCCACTCATGAAGC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3549429_3549941_3:0:0_0:0:0_bf/1
+GTACGACGACGGAGGAAGTGGGACTAAAGCTCTTGTTCAAAAAGTTCCAGAATGGCTTCGTACAGATCTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2774014_2774533_1:0:0_2:0:0_c0/1
+CTGAGCCACAGGGTAAGGGTTCATGCCCCATTGCATAGCCTGCATTACGATAGCCATACAGTCGGCTGGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3258454_3258975_1:0:0_3:0:0_c1/1
+TTCCTGACCCACAACCCGACCAACCCGTCCTGGGCCGACCGCGACCGCTTCGTGCTGTCCCATGGCGACG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2597923_2598447_0:0:0_1:0:0_c2/1
+CGCTGGAGCGACTGCGCGCAGCCTATCCCCACACCGCAGTTTGCACAGCATCTTAAAGGGACTCTCTCCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1051081_1051647_2:0:0_2:0:0_c3/1
+CGTAATGTTTCAGCACTGCGTCGGTTCCAGACTATATCTTCATAAATATCTGGGGACGTATCGCCTTCGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1810218_1810690_0:0:0_0:0:0_c4/1
+GGGAACGCTCACCCCAGATCAACTTAGCGAGACATATGCCGCCTTTAATCTCATCTGGCGAAAAATTGAT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1517442_1517941_1:0:0_1:0:0_c5/1
+TGGCAGCTTATTGGCGTACAAAGCTCCGCCCCTGCGGCTAAAGATCGCTGGCGCGCCGAAAACCGCGCTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2101810_2102339_1:0:0_1:0:0_c6/1
+CAGGTACTGAATAGCATCGCATCTCCCAGGGTAATAAAACCGACCTGTTTACCCGCTTCCACCTCTGCGG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3500086_3500688_2:0:0_1:0:1_c7/1
+AAACATGCCAAGACTGGTCTCCGCGCTGTAATTGGTCAGAACCAGATAGCCTTGCAGCCCCAGCACCATA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_392460_392967_0:0:0_2:0:0_c8/1
+AATATCCGGGCGGCGTACCAGCAGATCTGACGGTAATCCGCCTGGCAGTGTGGTCGGGATCGCGCCTTCT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_219522_220052_4:0:0_2:0:0_c9/1
+GGCAGTAAATCAGGACACGCCTGAATCAGCGAGGCAATATCCAGCGGCTGCGGCAACAATATTCGGGCGT
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2493623_2494113_0:0:0_0:0:0_ca/1
+GCGGCTGACGTCCAGCGAAAAACACCGCATTGTCGAGCGAGTGATTCGTCGCATTAACGAGCGTATCCCG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_757666_758157_1:0:0_2:0:0_cb/1
+TCATTCCATGGGTGGAAAAGCGGTAATGGCGCTGACGGCGCTTGCGCCCGATCGCATCGATCGTCTTGTC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_3166897_3167314_1:0:0_1:0:0_cc/1
+CGTCTGCGTCGGTTAGCTGCGGCGATAGCCCCGCGCCGTTAATTCTGTGCGGCGAGCGTCTCTACCTGAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_959417_959900_1:0:0_2:0:0_cd/1
+TGGGCGTACAGAACGGTACGACGCACCAGAAATTCATCATGGATAAGTATCCGGAAATCACCACGGTACC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_1208571_1209066_1:0:0_2:0:0_ce/1
+CGGTGGATATGCTGAGTGCGCTGCATATAGCGAATCGCAGCTGTTAAGGGTTCAAACATCAGCCCTTGCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4046134_4046620_1:0:0_2:0:0_cf/1
+ATTTCCGGCGTAATTTTATGACGTAAGCGGCGAACCAGGACATGAATCGTGCGGAGATCCGGAGTCTCTA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_2371050_2371525_3:0:0_1:0:0_d0/1
+GAACTCGACGCTATCGACGGCAGCGTGGCGGAAGGGGATGAGGATATCGCCCCGGAATCGGAAAGCGATG
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_697385_697872_1:0:0_1:0:0_d1/1
+GAGCTGGCGGACAAGGATTTTATCCTGATACAAAACGGCATCTCCGTAGATAATGAAAAAAGAGAGGAAA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4565448_4565984_0:0:0_3:0:0_d2/1
+AGACAATCAGCGTCAGCAGATTCGCCTCGCCGGCGAAATAAAGGTAATAGGGAAAAAGATCGGCATCGCC
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4448460_4448921_2:0:0_4:0:0_d3/1
+AACTCTAACCCCCACTCTCACTAACCTGCAAATTGCTGCTGGATTGTGGCTTCGCCATCTCCAGCCTGCA
++
+2222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222
+@SL1344_4572293_457