tools - bionix.git - Functional, highly-reproducible bioinformatics pipelines

Mode	Name	Size
-rw-r--r--	bwa-index.nix	438	log plain
-rw-r--r--	bwa-mem.nix	1011	log plain
-rw-r--r--	bwa.nix	114	log plain
-rw-r--r--	compression.nix	1348	log plain
-rw-r--r--	crumble-app.nix	377	log plain
-rw-r--r--	crumble.nix	100	log plain
-rw-r--r--	fastqc-app.nix	704	log plain
-rw-r--r--	fastqc-check.nix	295	log plain
-rw-r--r--	fastqc.nix	139	log plain
-rw-r--r--	gridss-callVariants.nix	1507	log plain
-rw-r--r--	gridss.nix	93	log plain
-rw-r--r--	infercnv-app.nix	2330	log plain
-rw-r--r--	infercnv-infer.nix	366	log plain
-rw-r--r--	infercnv-ngchmr.patch	616	log plain
-rw-r--r--	infercnv.nix	144	log plain
-rw-r--r--	mosdepth-depth.nix	398	log plain
-rw-r--r--	mosdepth-plot.nix	577	log plain
-rw-r--r--	mosdepth.nix	124	log plain
-rw-r--r--	platypus-callVariants.nix	1009	log plain
-rw-r--r--	platypus.nix	89	log plain
-rw-r--r--	samtools-faidx.nix	394	log plain
-rw-r--r--	samtools-flagstat.nix	211	log plain
-rw-r--r--	samtools-index.nix	479	log plain
-rw-r--r--	samtools-merge.nix	611	log plain
-rw-r--r--	samtools-sort.nix	828	log plain
-rw-r--r--	samtools-view.nix	746	log plain
-rw-r--r--	samtools.nix	300	log plain
-rw-r--r--	strelka-call.nix	1011	log plain
-rw-r--r--	strelka.nix	80	log plain